Kaupungin laajin museokauppa on varma kohde tuliaisten, lahjojen ja muistojen varalle. Ihanat korut, kortit ja kirjat, lelut ja hauskat arjen käyttötavarat saavat hyvälle mielelle. Pistäydy ostoksilla museovierailun yhteydessä tai muuten vain – museokauppa jokirannassa on avoinna joka päivä klo 11–19.

Museokauppa on myös kirjakauppa, josta löytyy erityisesti historiaa ja taidetta käsitteleviä kirjoja. Mukana on sekä tutkimuskirjallisuutta että yleisteoksia ja aina ajankohtaisia Turku-aiheisia kirjoja laidasta laitaan. Taidejulkaisuissa edustettuina ovat ajankohtaiset näyttelyjulkaisut kuin myös nykytaiteen ilmiöitä laajemmin avaavat teokset.

Museokaupan valikoimaan etsitään jatkuvasti uusia mielenkiintoisia tuotteita kestosuosikkien rinnalle. Valikoima vaihtuu sesonkien mukaan.